Będąc bezpośrednim lub pośrednim udziałowcem kilkudziesięciu spółek wchodzących w skład holdingu, Żegluga Polska S.A. pozostaje pośrednim właścicielem wszystkich statków Grupy PŻM, nad działalnością armatorską których roztacza swój nadzór.

Kontynuuje tradycje powołanej w 1919 roku w Krakowie, spółki Żegluga Polska S.A., jako pierwszego w dziejach polskiego armatora floty handlowej.